《表1 杜仲LOX基因家族信息》

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《杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究》


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通过Hmmer 3.0搜索,杜仲基因组共鉴定出23个LOX基因家族成员(表1)。23个LOX基因分布于12条scaffolds,每条scaffold上分布的基因数量为1~5个,而多基因分布的scaffolds上的基因呈聚集形式分布,形成串联重复,推测这些基因发生过复制事件。杜仲LOX基因内含子数量分布范围是0~6,有9个LOX基因不含内含子,有4个基因含5个内含子,有5个基因含6个内含子,其他LOX基因分别含有1~2个内含子,其中EU05484-RA的内含子序列长度显然长于其它LOX基因内含子序列,内含子具体分布位置如图1所示。亚细胞定位预测结果显示杜仲23个LOX基因有15个定位于细胞质,8个定位于叶绿体。