《表1 小麦VQ基因家族信息》
小麦的全基因组序列和蛋白序列自Phytozome数据库下载。使用HMMER软件搜索小麦蛋白质组数据库,共获得39条转录本序列。经过HMMER和SMART搜索,最终鉴定了25个VQ基因。统计结果表明(表1),小麦中VQ基因编码的蛋白质最短为66 aa(Traes_3AS_22575A326.1),最长为420 aa(Traes_5BL_C205AA973.1),蛋白质序列长度变化较大。大多数小麦VQ蛋白较短,25个VQ蛋白中仅有两个序列大于300个氨基酸;小麦VQ蛋白分子量(molecular weight,MWs)在7.13 kD(Traes_3AS_22575A326.1)到42.8 kD(Traes_5BL_C205AA973.1)之间;等电点(Isoelectric point,pI)分布在5.08(Traes_4BL_E4F2-9BBBC.1)到12.01(Traes_3AS_22575A326.1)之间,大多数VQ蛋白均为中性或偏碱性蛋白,其中仅有5个VQ蛋白偏酸性,等电点小于7.0。对基因的外显子-内含子结构组成进行分析,发现仅有一个VQ基因(Traes_3B_A958F1F75.1)含有1个内含子,其余基因均为单外显子基因。
图表编号 | XD00131426800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.28 |
作者 | 李虎滢、魏春茹、孟钰玉、范润侨、于秀梅、刘大群 |
绘制单位 | 河北农业大学生命科学学院、河北农业大学生命科学学院、河北农业大学生命科学学院、河北农业大学生命科学学院、河北农业大学生命科学学院、河北农业大学河北省植物生理与分子病理学重点实验室、河北农业大学河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心、河北农业大学河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心、中国农业科学院研究生院 |
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