《表1 玉米CCT基因家族信息》

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《玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析》

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经SMART与CDD数据库对ZmCCT23与ZmCCT43筛选与鉴定无法识别T001转录因子，所以选用T002转录因子

利用Pfam数据库搜索并下载CCT基因家族中的隐马氏模型文件，Pfam号码：PF06203，通过在线数据库SMART和CDD比对鉴定，除去冗余并检查缺失，获得含有CCT结构域的基因，最终获得57个玉米序列，分别命名为ZmCCT1～ZmCCT57（表1）。比较分析玉米57个CCT蛋白序列，结果显示不同的蛋白差异较大：氨基酸长度为181 aa (ZmCCT42）～641 aa (ZmCCT41），开放阅读框长度788 bp (ZmCCT17）～34099 bp (ZmCCT43），分子量为19.52 kD (ZmCCT42）～71.01 kD (ZmCCT41），等电点为4.43 (ZmCCT27）～12.00 (ZmCCT50），含有1 (ZmCCT18）～29 (ZmCCT47）个外显子。此外，有43个编码蛋白等电点都小于7，表明这些CCT基因可能编码弱酸性蛋白，可能会在酸性亚细胞环境中发挥作用。