《表1 茶树NAC家族基因信息》

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《茶树NAC基因的鉴定及其在逆境反应中的表达调控分析》


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根据NAC保守结构域的“隐马尔可夫模型”文件PF01849和PF02365,利用HMMER软件检索茶树蛋白质数据库,得到115个CsNAC成员.以拟南芥NAC蛋白序列对茶树蛋白质数据库进行同源比对,获得113个CsNAC成员.经过去冗余、CDS完整性以及保守结构域长度分析,共鉴定得到108个CsNAC成员,分别命名为CsNAC1~CsNAC108(表1).蛋白质理化性质分析显示,CsNAC家族成员氨基酸含量在134 (CsNAC93)~1950(CsNAC97)之间,蛋白质分子量介于15.4(CsNAC93)~222(CsNAC97),与氨基酸含量成正比;蛋白质等电点分布在4.6(CsNAC99)~9.91(CsNAC83)之间.除CsNAC97外,其他CsNAC成员的平均亲水系数(GRAVY值)都小于0,表明这些CsNAC均为亲水蛋白.