《表2 茶树TCP基因家族成员基本信息》

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《茶树TCP家族的全基因组鉴定及其表达分析》


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利用24个拟南芥TCP家族基因的蛋白质序列,对‘舒茶早’茶树基因组数据库进行本地Blast P,结合HMMER检索茶树全基因组数据库和SMART网站对茶树候选TCP基因结构域完整性的鉴定,共鉴定到37个TCP家族基因,根据茶树拉丁名的缩写,将其分别命名为CsTCP1~CsTCP37。蛋白质特性分析表明CsTCP家族成员平均含有363个氨基酸,其中CsTCP21最长,含有607个氨基酸,CsTCP37最短,含有150个氨基酸;分子量最大的约为67.6 kD,最小的16.8 kD;等电点(pI)分布在5.1(CsTCP24)~10.52(CsTCP23)之间。对结构域的位置分析发现,CsTCP家族成员中,大部分TCP结构域靠近N端,少数位于中部或靠近C端(表2)。