《表1 玉米SPP基因家族成员基本信息》

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《玉米SPP基因家族的全基因组鉴定及表达分析》


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利用拟南芥SPP(Lunn,2003)蛋白序列在Uniprot、MaizeGDB和NCBI数据库中进行BLASTP比对(e-value<1e-10),得到2个玉米候选SPP基因。SMART和Pfam在线软件分析显示这两个基因均包括S6PP结构域(Accession:PF05116)和S6PP_C结构域(Accession:PF08472)。根据玉米B73自交系V3版参考基因组分析,SPP基因分别位于第8和第10染色体上(图1)。按照玉米SPP基因在染色体上的排列顺序,将其命名为ZmSPP1和ZmSPP2。ZmSPP1和ZmSPP2蛋白的长度分别为423和437个氨基酸,分子量分别为47.214 kD和48.585 kD,等电点分别为5.48和6.39。ZmSPP1和ZmSPP2的蛋白不稳定系数分别为34.76和31.54,均小于40,属于稳定性蛋白。采用PSORT在线软件预测蛋白的亚细胞定位,发现ZmSPP被定位在细胞质中(表1)。