《表1 玉米SPP基因家族成员基本信息》
利用拟南芥SPP(Lunn,2003)蛋白序列在Uniprot、MaizeGDB和NCBI数据库中进行BLASTP比对(e-value<1e-10),得到2个玉米候选SPP基因。SMART和Pfam在线软件分析显示这两个基因均包括S6PP结构域(Accession:PF05116)和S6PP_C结构域(Accession:PF08472)。根据玉米B73自交系V3版参考基因组分析,SPP基因分别位于第8和第10染色体上(图1)。按照玉米SPP基因在染色体上的排列顺序,将其命名为ZmSPP1和ZmSPP2。ZmSPP1和ZmSPP2蛋白的长度分别为423和437个氨基酸,分子量分别为47.214 kD和48.585 kD,等电点分别为5.48和6.39。ZmSPP1和ZmSPP2的蛋白不稳定系数分别为34.76和31.54,均小于40,属于稳定性蛋白。采用PSORT在线软件预测蛋白的亚细胞定位,发现ZmSPP被定位在细胞质中(表1)。
图表编号 | XD00117203800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.14 |
作者 | 何冰、时丕彪、吕远大、陈国祥 |
绘制单位 | 南京师范大学生命科学学院、盐城市新洋农业试验站、江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所江苏省农业生物学重点实验室、南京师范大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |