《表1 棉花CLE基因家族成员信息》
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《棉花CLE多肽家族的全基因组鉴定与生物信息学分析》
利用拟南芥中已鉴定的CLE蛋白序列和上述方法,我们最终共获得148个棉花CLE基因,其中亚洲棉有21个、雷蒙德氏棉有26个,陆地棉和海岛棉分别有49和52个,分别命名为GaCLE1~GaCLE21、GrCLE1~GrCLE26、GhCLE1~GhCLE49和GbCLE1~GbCLE52(表1)。对棉花CLE多肽基因家族的理化性质分析发现,该家族编码的蛋白长度在73~453个氨基酸,最大和最小分子量分别为47 996.26 Da和8 276.52 Da。GaCLE8的等电点最小,为6.82;GbCLE23和GbCLE46的等电点最大,为12.22,平均值为10.48,表明该家族蛋白偏碱性。信号肽预测发现148个棉花CLE多肽中,103个具有信号肽结构,45个没有预测到信号肽的存在。亚洲棉、雷蒙德氏棉、陆地棉中无信号肽的CLE多肽分别占各自总数的38.1%,42.3%和40.8%,海岛棉中无信号肽CLE最少,仅占总数的11.5%。
图表编号 | XD0070692700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.15 |
作者 | 袁娜、李阳、杨郁文、张保龙、杜建厂 |
绘制单位 | 江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所、江苏省农业生物学重点实验室、江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所、江苏省农业生物学重点实验室、江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所、江苏省农业生物学重点实验室、江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所、江苏省农业生物学重点实验室、江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所、江苏省农业生物学重点实验室 |
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