《表1 毛竹PIN基因家族成员信息》

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《毛竹PIN基因家族的鉴定与生物信息学分析》

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通过拟南芥8条PIN蛋白序列、水稻12条PIN蛋白序列在毛竹基因组数据库中进行比对，去除无Mem＿trans保守结构域的序列，共发现7条毛竹PIN蛋白序列。序列分析表明，PIN家族的蛋白等电点为6.4～9.48，蛋白序列长度为219～611个氨基酸，氨基酸均长约为467，分子量大小为23.80～66.30 kD，平均分子量为50.66 kD，除PhePIN3-2外，其余蛋白理论等电点均大于7；不稳定性系数分析表明，PheP-IN1-4、PhePIN1-3、PhePIN5、PhePIN3-2为稳定蛋白（不稳定性系数<40），PhePIN3-1、PhePIN1-2和PheP-IN1-1为不稳定蛋白（不稳定系数>40），但是其不稳定系数均为40左右，差异不明显；亲水疏水性分析表明，除PhePIN5和PhePIN3-2为疏水蛋白外，其余均为两性蛋白（亲水性介于0.5为两性蛋白，脂溶性大于100为疏水性蛋白）（王占军等，2014）；保守结构域分析表明，PhePIN3-1、PhePIN1-3有两个Mem＿trans保守结构域，其余均有一个Mem＿trans保守结构域（表1）；基因结构分析表明，PhePIN3-1和PhePIN3-2在同一进化分支上但是PhePIN3-2无内含子结构，PhePIN1-3有6个内含子，与PhePIN3-2只差一个氨基酸的PhePIN5有3个内含子（图1）。