《表1 毛竹PP2C家族基因的q RT-PCR引物信息》

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《毛竹PP2C基因家族鉴定与表达分析》


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综合毛竹PP2C基因的系统进化分析结果与启动子顺式作用元件预测结果,在9个亚家族中各选取1~2个富含激素响应元件与胁迫相关元件共计11个毛竹PP2C基因用于后续表达检测。利用Primer Premier 5软件设计q RT-PCR引物(表1),由杭州有康生物科技公司合成。以毛竹nucleotide tract-binding protein(NTB)为内参基因(Fan et al.,2013)。PCR反应体系:c DNA 0.5μL,10μmol/L上下游引物各0.4μL,2×SYBR Premix Ex TaqTMⅡ(Ta Ka Ra,大连)5μL,dd H2O 3.7μL。PCR反应程序:95℃预变性3 min;95℃变性10 s,60℃退火20s,72℃延伸20 s,40个循环。每个反应设定3个重复。实验仪器为CFX96TM Real-Time PCR Detec‐tion System (Bio-Rad,美国)。相对定量计算采用2-ΔΔCt方法。