《表1 基因q RT-PCR引物序列》
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《基于转录组测序探究PM2.5损伤肺上皮细胞BEAS-2B的相关机制》
收集对照组和PM2.5组细胞并提取总RNA,逆转录后进行实时荧光定量PCR实验。使用Primer-BLAST,根据转录组相关基因的序列设计基因特异性引物(表1)。目的基因包括核转录因子激活蛋白-1转录因子亚单位(FOSB、FOSL1)、基质金属肽酶1(MMP1)、集落刺激因子2(CSF2)、白细胞介素-6(IL-6)和黏蛋白5AC(MUC5AC)。将提取的RNA逆转录为cDNA后依据SYBR Green PCR Master Mix试剂盒说明书取2μL cDNA进行实时荧光定量反应。反应条件:95℃5 min;95℃10 s,58℃30 s,40次循环。在实验中以Actin为内参照。用2-ΔΔCt法计算相对表达量,并与RNA-seq测序后相关基因表达量进行比较。
图表编号 | XD00139394500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.15 |
作者 | 胡玲娟、何翔、张雷、冉琴、李国平 |
绘制单位 | 西南医科大学临床医学院、西南医科大学临床医学院、西南交通大学附属医院成都市第三人民医院呼吸内科 |
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