《表1 HaWRKY基因家族成员信息》
本研究从Ensamble数据库获取向日葵基因组信息,使用WRKY种子文件PF03106进行BlastP同源性搜索并经Pfam数据库和NCBI CDD鉴定向日葵WRKY结构域,得到了117个Ha WRKY家族基因。通过生物信息学分析这117个Ha WRKY蛋白等电点在(HaWRKY33)5.01~10.19(HaWRKY29)之间,蛋白质大小在(HaWRKY52)59~940(HaWRKY86)个氨基酸之内,平均氨基酸个数为345个,分子量大小(MW)在6.790 0~108.001 4 kD之间变动。结合进化树分组分析可以看出Ⅱd家族成员富含碱性氨基酸,等电点在(HaWRKY59)9.19~(HaWRKY29)10.19之间(表1)。
图表编号 | XD00152946800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.28 |
作者 | 项玉婷、王景、曾俊岚、杨春贤 |
绘制单位 | 西南大学生命科学学院西南大学—西藏农牧学院药用植物联合研发中心、西南大学生命科学学院西南大学—西藏农牧学院药用植物联合研发中心、西南大学生命科学学院西南大学—西藏农牧学院药用植物联合研发中心、西南大学生命科学学院西南大学—西藏农牧学院药用植物联合研发中心 |
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