《表1 番茄全基因组YUCCA家族成员信息》

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《基于全基因组的番茄YUCCA基因家族生物信息学分析》

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根据已知物种YUCCA蛋白序列，在番茄蛋白质数据库中进行搜索，共鉴定得到18个番茄YUCCA基因家族候选成员，然后将18个番茄YUCCA基因家族候选成员的蛋白质序列文件提交到Pfam数据库中，鉴定其保守结构域。鉴定发现，有一条蛋白质序列不含任何保守结构域，其余17条序列均含有YUCCA家族特有的保守结构域，最终确定了17个番茄YUCCA基因家族成员。根据基因所在染色体位置，分别命名为SlYUCCA1～SlYUCCA17，列出17个番茄YUCCA基因的基因名称、基因ID、基因位置、编码氨基酸长度、等电点、内含子数和不稳定指数（表1）。其编码蛋白质的氨基酸长度在153（SlYUC-CA2）～527（SlYUCCA3）之间；对应的蛋白质分子量在17311（SlYUCCA2）～60016（SlYUCCA3）之间；等电点（pI）最小为5.21（SlYUCCA6），最大为9.15（SlYUCCA-10）；不稳定指数分布在23（SlYUCCA17）～51（SlYUC-CA15）之间。