《表1 番茄typeⅡ型MADS-box转录因子家族成员信息》

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《番茄type Ⅱ型MADS-box基因家族生物信息学分析》


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利用生物信息学手段,分析了32个番茄typeⅡ型MADS-box转录因子家族成员蛋白长度、染色体定位、分子量、理论等电点等基本属性(表1)。结果显示在32个typeⅡ型MADS-box转录因子家族成员中,其蛋白大小在177~279 aa之间,其最大的是SVP亚族的Solyc01g105800基因,最小的是MIKC*亚族的Solyc03g019710基因。分子量和等电点大小分别介于20 703.9~30 846.96和5.98~9.79之间,其分子量最大的均是AGL17亚族的Solyc01g087990,最小的均是MIKC*亚族的Solyc03g019710。32个番茄typeⅡ型MADS-box转录因子家族成员染色体的分布不均匀,在2号染色体上分布较多,为6条;1号染色体上有4条;3号染色体上有4条;4号、5号、8号、12号染色体上各有3条;6号染色体上有2条;7号染色体上有1条;9号和10号染色体是0条。不稳定系数在71.62~97.02之间,其最小的是AP1家族的Solyc02g-065730,最大的是FLC家族的Solyc12g087830基因。