《表2 蓖麻GRAS转录因子家族成员的理化性质预测结果》
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《蓖麻GRAS转录因子家族的全基因组分析及逆境胁迫响应》
以含有GRAS结构域的隐马尔科夫模型(PF03514)为靶序列,使用HMMER3.0扫描和提取蓖麻基因组中具有GRAS结构域的蛋白序列,综合NCBI、Pfam与SMART数据库的筛选与比对结果后,鉴定出48个蓖麻GRAS转录因子家族成员,由于蓖麻基因组信息尚不完善,无染色体信息,因此按照其在scaffolds上的排列位置将其命名为Rc GRAS1~Rc GRAS48。Rc GRAS转录因子家族成员的理化性质如表2所示。通过亲水性平均值可以看出,蓖麻GRAS基因编码的蛋白全部为亲水蛋白,且酸性蛋白质约占94%,其中最长的为GRAS38(843aa),最短的为GRAS36(88aa),等电点在4.82~10.21之间,相对分子量介于10096.8~90986.6之间。
图表编号 | XD00128626100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.16 |
作者 | 韩雯毓、李国瑞、风兰、李孟建、白英俊、孙佳欣、闫星伊、王双、赵秀平、陈永胜 |
绘制单位 | 内蒙古民族大学农学院、内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心、内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室、内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学农学院、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学农学院、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学农学院、内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心、内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室、内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心、内蒙古民族大学生命科学学院 |
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