《表1 It WRKY转录因子家族成员的鉴定》
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《甘薯近缘野生种三浅裂野牵牛WRKY基因家族的生物信息学分析》
注:X:该蛋白锌指结构缺失;U:染色体位置未知
在野生甘薯三浅裂野牵牛的基因组数据库中找到114条WRKY基因序列,通过SMART在线工具对得到的序列进行分析,去掉无典型WRKY结构域和不同转录本的序列后,保留82条序列作为三浅裂野牵牛WRKY转录因子家族候选基因,根据它们在染色体上的位置重新命名为It WRKY1~It WRKY82(表1)。分析It WRKY基因的特征,包括WRKY结构域,锌指结构,氨基酸序列的长度,蛋白质分子量(MW),等电点(p I)等。在82种It WRKY蛋白中,最小蛋白质WRKY70具有116个氨基酸(aa),而最大的蛋白质是It WRKY38 (710 aa)。蛋白质的分子量(MW)范围为13.34~76.28 k D,等电点(p I)范围为4.85 (It W-RKY68)~10.33 (It WRKY41)。
图表编号 | XD00194428900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.14 |
作者 | 杜泰峰、侯夫云、秦桢、王庆美、张立明 |
绘制单位 | 山东师范大学生命科学学院、山东省农业科学院作物研究所农业部黄淮海薯类科学观测实验站、山东省农业科学院作物研究所农业部黄淮海薯类科学观测实验站、山东省农业科学院作物研究所农业部黄淮海薯类科学观测实验站、山东省农业科学院作物研究所农业部黄淮海薯类科学观测实验站、山东省农业科学院作物研究所农业部黄淮海薯类科学观测实验站 |
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