《表1 芥菜GRF转录因子家族成员信息》

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《芥菜GRF转录因子家族的全基因组鉴定与分析》


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本地Blastp初步筛选出69个芥菜GRF家族候选基因后,用HMMER从69个候选基因中鉴定出29个GRF家族成员,SMART在线网站验证29个GRF家族成员都有完整的WRC和QLQ结构域,同样方法在黑芥全基因中鉴定出10个GRF家族基因。依据转录因子家族成员在芥菜染色体上的排列顺序依次命名,统计芥菜GRF家族成员所在染色体、基因起始终止位置、蛋白质长度和结构域起始终止位置等信息,ProtParam在线软件分析了GRF家族成员的理化特征(表1)。