《表1 葫芦科14-3-3(GRF)基因家族成员信息》

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《葫芦科14-3-3(GRF)基因家族的鉴定及进化分析》


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通过生物信息学,以拟南芥15个14-3-3基因的蛋白序列为Query,利用BLAST软件在葫芦科作物西瓜、甜瓜、黄瓜、中国南瓜、印度南瓜、美洲南瓜和瓠瓜中分别鉴定出10、9、10、15、15、15和9个14-3-3基因家族同源体(表1),其中甜瓜中鉴定出的9个14-3-3同源基因与已发表文章中的鉴定结果一致(马勇等,2013)。根据14-3-3基因在染色上的位置,按“物种+GRF+数字”的形式依次将其命名。14-3-3(GRF)基因的核苷酸序列差异较大,但其编码的蛋白序列大部分都小于300 aa,分子量在27~33 k D之间(表1)。通过等电点预测,发现除了印度南瓜中基因Cma GRF06的等电点为8.94外(碱性蛋白),葫芦科作物中其他14-3-3蛋白都为酸性氨基酸(p I<7.0)。