《表2 物种内14-3-3 (GRF)基因家族的共线性分析成员信息》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《葫芦科14-3-3(GRF)基因家族的鉴定及进化分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

注:1:物种；2:数目；3:染色体；4:起始位置；5:终止位置；6:长度（bp）；7:基因1；8:基因2；a:南瓜属亚基因组A；b:南瓜属亚基因组B （Sun et al.，2017）

近年来，葫芦科作物基因组（西瓜，甜瓜，黄瓜，中国南瓜，印度南瓜，美洲南瓜和瓠瓜）的公布，为全基因组范围鉴定基因家族并分析其进化提供了重要的数据平台。高度保守的14-3-3（GRF)基因蛋白可特异识别并结合磷酸化位点，通过改变靶蛋白理化性质（如蛋白活性，构象和稳定性等）而广泛参与调节细胞代谢、信号传导及逆境胁迫响应等过程中（李菲等，2017；Yashvardhini et al.，2018）。本研究通过生物信息学在葫芦科7个基因组中共鉴定出83个14-3-3（GRF）基因，其中西瓜10个、甜瓜9个、黄瓜10个、瓠瓜9个，3个南瓜基因组各15个（表1）。而甜瓜中鉴定出的9个14-3-3 （GRF）基因与已发表文章中的结果一致（马勇等，2013）。14-3-3 （GRF）基因家族在不同物种内包含的家族成员数目差异较大，如拟南芥、番茄、大豆、苜蓿、杨树、水稻中分别鉴定出15、12、18、11、14、8个14-3-3 （GRF）基因同源体（Rosenquist et al.，2001；Xu and Shi，2006；李菲等，2017；李昕文等，2017）。在葫芦科中，冬瓜族（Benincaseae）作物西瓜、甜瓜、黄瓜、瓠瓜基因组内14-3-3 （GRF）基因数目相似，而南瓜族（Cucurbiteae）3个物种内都包含15个14-3-3 (GRF）基因，表明该基因家族在冬瓜族和南瓜族分化时出现差异。共线性分析表明，在西瓜、甜瓜、黄瓜和瓠瓜基因组中都检测到1～2个染色体片段复制（表2），而在南瓜3个物种中检测到的染色体片段复制事件多发生于该属两个亚基因组间，表明基因组复制事件是冬瓜族和南瓜族物种内14-3-3（GRF）基因家族成员数目差异的主要原因（Vision et al.，2000；Sun et al.，2017）。理化性质分析结果表明葫芦科中的绝大部分14-3-3 （GRF）蛋白分子量约为30 k D，且为酸性氨基酸（p I<7.0）（表1），这与已发表的研究结果相一致（马勇等，2013；Tian et al.，2015；李菲等，2017）。