《表2 甘蓝PMEI基因家族成员共线性分析》

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《甘蓝PMEI家族基因结构、基因组分布和表达分析》


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注:A列和B列同行示甘蓝基因组内共线性;C列和D列同行示拟南芥和甘蓝基因组间共线性。

为了进一步推断系统进化机制,构建了甘蓝和拟南芥PMEI基因家族成员组间重复区的共线性分析图,结果显示甘蓝中有73个基因与拟南芥基因具有共线性关系(表2),这表明WGT是甘蓝PMEI基因家族倍增的主要机制。其中,BoPMEI17和BoPMEI74分别与拟南芥中的3个基因存在共线性关系,这两个基因可能在甘蓝PMEI基因家族进化过程中起到关键核心作用。同时发现,在甘蓝全基因组中,PMEI基因家族中出现了更多的串联重复(7.9%)。