《表2 树莓ACS基因家族成员序列分析》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《树莓1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶基因(RiACS)家族成员的克隆及生物信息学分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

由蔷薇科ACS蛋白与拟南芥ACS蛋白序列比对，得到7个蔷薇科蛋白保守结构域序列如下:IQMGLAEN、FQDY、FCLADPGDAFL、NPSNPL-GT、YSLSKDMG、KMSSFGLVSSQTQ、PGW-FRVCFA，将其分别与树莓基因组进行比对后得到6条树莓ACS基因家族成员的电子序列，将其按照染色体顺序命名。根据电子序列设计引物进行基因组PCR（图1），将PCR胶回收产物连接克隆载体测序，得到树莓ACS家族成员的基因序列。所得基因序列已上传至NCBI数据库，序列号为MK388675、MK388676、MK388677、MK388678、MK388679、MK388680。对其进行序列分析（表2）发现，RiACS1-6的GC含量均小于50%，与全基因组GC含量吻合[28]，ORF长度在1 657～2 432bp之间，除了RiACS1和RiACS2外其余均包含部分5′非翻译区和3′非翻译区序列，RiACS1含有2个内含子而其余均含有3个内含子，内含子的长度不等，最短的仅85bp而最长的达713bp，去除内含子后得到的CDS序列长度在1 392～1 608bp之间。