《表2 克里曼丁橘CclSAUR基因家族成员的序列特征及亚细胞定位预测》

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《柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析》


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通过生物信息学分析,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等柑橘基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因,根据其所在染色体或scaffold的位置顺序,依次从上端到下端进行编号,分别命名为Cm SAUR1~Cm SAUR69(香橼)、Cg SAUR1~Cg SAUR62(柚)、Crm SAUR1~Crm SAUR58(莽山野橘)、Ccl SAUR1~Ccl SAUR70(克里曼丁橘)。表2为克里曼丁橘CclSAUR家族基因信息。这些SAUR基因家族成员编码68~215个氨基酸,等电点(Theoretical Isoelectric Point,p I)为4.75~10.69,分子量(Molecular Weight,Mw)为6.84~29.84 kD(表2)。蛋白质亚细胞定位预测分析显示,柑橘SAUR基因主要定位在细胞核和线粒体,少部分定位在细胞质、质膜、细胞外等(表2)。