《表3 顺式元件的功能注释》

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《柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析》


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为了了解基因表达的响应机制,分析了克里曼丁橘中70个CclSAUR基因的启动子顺式作用元件。在基因上游2 000 bp的序列中,主要有光响应、转录因子结合(MYB和MYC等)、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢、类黄酮代谢调控等顺式作用元件(表3)。在这70个CclSAUR基因的启动子中,光响应、MYB和MYC结合元件的数量最多,分别含有796、543和364个元件,所有CclSAUR基因都含有这三类响应元件。激素响应元件主要包括脱落酸(abscisic acid,ABA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、乙烯(ethylene)、生长素(auxin,IAA)、水杨酸(salicylic acid,SA)、赤霉素(gibberellin,GA)。70个CclSAUR基因启动子中共发现193个脱落酸和178个茉莉酸甲酯响应元件,分别分布在49个和51个CclSAUR基因的启动子区域。只有27个CclSAUR基因的启动子区域有生长素响应元件(auxin-responsive elements,AuxREs)。非生物胁迫响应元件中,低温顺式作用元件(low temperature responsiveness,LTR)存在于34个CclSAUR基因(图2)。