《表2 启动子pSlTIP-1序列中的顺式作用元件及相关功能预测》

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《番茄SlTIP-1基因的克隆、表达及启动子活性分析》

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筛选植物组织特异表达基因的方法主要有消减杂交、抑制性消减文库杂交、mRNA差异显示和cDNA代表性差异分析等。近年来高通量测序技术飞速发展，大量基因组、转录组和芯片数据汇集于公共数据库中，为新基因筛选、克隆及功能研究提供了便利。黄珂等（2018）从普通野生稻（Oryza rufipogon）转录组文库筛选到一个根特异表达基因OrRSG，克隆其启动子序列，与GUS报告基因融合转化拟南芥，GUS组织化学结果表明OrRSG启动子调控GUS基因在根部特异表达。冯婵莹等（2015）以根特异表达基因为模板，在番茄表达谱中筛选得到95个根特异表达基因，同时通过同源比对在水稻和拟南芥中分别得到95和93个上述根特异表达基因的直系同源基因，并对这3个物种根特异表达基因的表达模式开展研究，结果表明直系同源基因的表达在不同物种中并不完全一致。本文利用直系同源基因比对结合实时定量PCR方法，筛选获得一个根特异表达基因SlTIP-1并克隆该基因及其启动子。启动子顺式作用元件分析（表2）、实时定量PCR检验（图7）和构建植物表达载体进行转基因功能验证（图10），均证明SlTIP-1在根部特异性表达，该结果与514和1 258 bp HvTIP2；1启动子均驱动GUS报告基因在转基因烟草根部特异性表达相一致（徐登安等2015）。