《表2 TaAIRP2-1A、-1B、-1D启动子顺式作用元件的数目和功能》

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《小麦E3泛素连接酶基因TaAIRP2-1B克隆及功能分析》

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参照拟南芥基因AtAIRP2(At5g01520）编码的氨基酸序列，在小麦品种旱选10中克隆了小麦TaAIRP2基因的3个部分同源基因，在URGI数据库中进行序列比对分析，三者分别位于染色体1A、1B和1D，因此命名为TaAIRP2-1A、TaAIRP2-1B和TaAIRP2-1D。其中TaAIRP2-1A的序列全长和编码序列长度分别为3393 bp、741 bp，TaAIRP2-1B分别为3859 bp和729 bp，TaAIRP2-1D分别为2919 bp和741 bp。TaAIRP2-1A、TaAIRP2-1B和TaAIRP2-1D基因结构相同，都包括4个内含子和5个外显子，分别编码246、242和246个氨基酸。通过基因编码区序列对比分析，TaAIRP2-1A和TaAIRP2-1B序列的相似度为99.59%，Ta AIRP2-1A和Ta AIRP2-1D序列的相似度为98.92%，Ta AIRP2-1B和Ta AIRP2-1D序列的相似度为99.18%，都属于RING型E3泛素连接酶家族（图1A）。3个部分同源基因的启动子区序列差异较大，顺式作用元件的数目和功能也有差别，但都具有与胁迫应答相关的ABA应答元件、MYBHv1结合位点、MeJA应答元件（表2）。对不同物种AIRP2蛋白的进化分析结果表明，小麦TaAIRP2-1A与TaAIRP2-1B之间的相似性最高，而TaAIRP2-1D与粗山羊草AetAIRP2之间的相似性最高（图1B）。由于3个基因的序列相似性非常高（RING型结构域完全一致），所以选取TaAIRP2-1B为代表进行后续研究。