《表1 树莓ACS基因家族成员克隆引物》
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《树莓1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶基因(RiACS)家族成员的克隆及生物信息学分析》
根据所得电子序列使用Primer Premier 5.0软件设计引物(表1),由北京瑞博兴科生物技术公司合成。取树莓组培苗叶片200 mg使用植物DNA提取试剂盒提取基因组DNA,然后进行PCR扩增,PCR体系为:金牌mix 45μL,上游引物(10μmol/L)2μL,下游引物(10μmol/L)2μL,模板(100ng/μL)1μL。PCR条件为:98℃,2min;98℃10s,Tm(RiACS1-6分别为:54、55、57、52、57、56℃)15s,72℃,45s,35个循环;72℃,5 min。PCR产物经胶回收后连接到pClone007克隆载体并转化大肠杆菌感受态细胞,经过夜培养后挑取单克隆摇菌并进行菌液PCR,使用PCR呈阳性的菌液提取质粒,提取的质粒送北京睿博兴科生物技术有限公司测序。测序所得基因序列使用SnapGene软件分析GC含量,使用Augustus程序(http://bioinf.uni-greifswald.de/augustus/)分析开放阅读框(ORF,Open Reading Frame)和内含子,并获得CDS(Coding Sequences)序列和其所编码的蛋白序列[21],使用DNAMAN软件比较基因序列和蛋白序列之间的相似性。
图表编号 | XD0052160300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.01 |
作者 | 周义杰、闫希焕、高亭豪、刘芳、杨明峰、马兰青 |
绘制单位 | 北京农学院植物科学技术学院、农业农村部华北都市农业重点实验室、北京农学院植物科学技术学院、农业农村部华北都市农业重点实验室、生物与资源环境学院、农业农村部华北都市农业重点实验室、生物与资源环境学院、农业农村部华北都市农业重点实验室、生物与资源环境学院、农业农村部华北都市农业重点实验室、生物与资源环境学院、农业农村部华北都市农业重点实验室、北京农学院北京林果业生态环境功能提升协同创新中心 |
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