《表2 拟南芥、甘蓝型油菜、白菜和甘蓝CAX家族基因的拷贝数比较分析》
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《甘蓝型油菜钙离子转运蛋白CAX家族基因生物信息学及其对镉胁迫响应表达分析》
利用拟南芥CAX家族7个成员的基因ID号以及氨基酸序列为查询对象,在NCBI数据库和油菜数据库中进行BLAST搜索分析。我们分别在二倍体十字花科作物白菜和甘蓝中鉴定到了8个和9个CAX成员,同时在异源四倍体甘蓝型油菜中鉴定到17个BnCAXs(表2),表明甘蓝型油菜在形成过程发生基因重组时并未出现基因缺失和增加事件。甘蓝型油菜的基因组最大,而且包含的CAX成员也最多;但在甘蓝型油菜、白菜和甘蓝中,CAX6均发生缺失。与拟南芥AtCAX家族基因一样,甘蓝型油菜CAX家族基因同样划分为5个亚家族,即BnaCAX1到BnaCAX5亚家族,共包含17个成员,分别为4个BnaCAX1、6个BnaCAX2、2个BnaCAX3、2个BnaCAX4以及3个BnaCAX5。
图表编号 | XD0086761000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.20 |
作者 | 廖琼、周婷、肖燕、唐天骄、宋海星、官春云、华营鹏、张振华 |
绘制单位 | 湖南农业大学资源环境学院、南方粮油作物协同创新中心、湖南农业大学资源环境学院、南方粮油作物协同创新中心、湖南农业大学资源环境学院、南方粮油作物协同创新中心、湖南农业大学资源环境学院、南方粮油作物协同创新中心、湖南农业大学资源环境学院、南方粮油作物协同创新中心、国家油料作物改良中心湖南分中心、湖南农业大学资源环境学院、南方粮油作物协同创新中心、湖南农业大学资源环境学院、南方粮油作物协同创新中心 |
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