《表3 甘蓝型油菜CAX家族成员信息》

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《甘蓝型油菜钙离子转运蛋白CAX家族基因生物信息学及其对镉胁迫响应表达分析》


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甘蓝型油菜CAX家族家族成员按照与拟南芥CAX家族的同源性可划分为CAX1~5这5个亚类但亚类之间的氨基酸序列还是存在很大差异。为了确定甘蓝型油菜CAX蛋白序列的保守区域,我们利用MEME对甘蓝型油菜CAX家族成员进行了保守基序的预测和分析,保守基序(motif)的数目定义为10。预测结果如图4,除BnaCn.CAX4-1以外的16个BnaCAXs成员编码蛋白均包含所预测的10个保守区段。BnaCn.CAX4-1的氨基酸序列只预测到7个保守基序,不包括3、8、10这三个基序(图4-A)。由此可以推断其中的1、2、4、5、6、7、9这7个基序是甘蓝型油菜CAX家族的特征序列(图4-B),可以作为鉴别BnaCAX家族成员的依据。