《表2 甘蓝型油菜NBS-LRR基因家族保守基序及其序列(CNL类)》
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《甘蓝型油菜NBS-LRR基因家族的鉴定及密码子偏好性分析》
通过对463个甘蓝型油菜NBS-LRR基因的保守分析结果和保守基序对应序列(表2),可发现CNL-A类基因主要由motif 1-4、motif 6-8、motif 12和motif 15组成,CNL-B类主要由motif 2-6、motif 9-12和motif 14-15构成,CNL-C主要由motif 2、motif4-7、motif 12和motif 15-16构成,CNL-D类主要由motif 1、motif 3-4、motif 7-10、motif 12和motif 16构成(图2)。TNL-A中主要由motif 1、motif 3-7、motifs 9-10、motif 13和motif 15组成,TNL-G主要有motif 1-4、motif 6-10和motif 13-16,TNL-ECD共同的保守结构域有motif 1-2、motif 4-10和motif 13-15,个别序列有所差异。TNL-FHB的保守基序主要有motif 1-10和motif 13-15。整体而言,每一类均含有多个相同的保守域,并且每类中均含有16个中的大部分motif,说明该家族成员CNL类基因和TNL类基因都具有高度的保守性。另外,我们发现,NBS-LRR基因识别的结构域有NBS、LRR、CC、TIR常见结构域。
图表编号 | XD00216397700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.01 |
作者 | 冯书燕、陈辉龙、李强、王丽霞、张伟萌、王彤、崔春琳、李苗苗、于滢、聂付磊、宋小明 |
绘制单位 | 华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院、唐山师范学院生物科学系、华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院、华北理工大学生命科学学院 |
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