《表2 斑马鱼DEAD-box家族蛋白保守基序》

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《斑马鱼DEAD-box家族的分子结构特征及进化分析》

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通过MEME 5.04在线预测斑马鱼DEAD-box家族成员的蛋白保守基序，获得15个保守基序（图1A）。各个成员包含的基序相对保守，且存在一定差异（图1B），如ddx58预测结果显示仅含有1个保守基序，ddx24和ddx28包含有6个保守基序，ddx47、ddx51和ddx56包含有7个保守基序，ddx18和ddx55包含有8个保守基序，但大多数蛋白序列包含9个及以上的保守基序。除了ddx47和ddx58之外，其他所有成员序列中均存在D-E-A-D保守基序。同时我们发现不同成员往往具有相同的基序类型和特定的基序排列顺序，大多数按照14-2-4-13-5-3-6-11-10-15-8-7-1-9-12的基序顺序排列，表明在斑马鱼中DEAD-box家族各成员之间相对保守，且保守基序长度在15～50个氨基酸之间（表2）。