《表4 茶树Cs AAP亚家族蛋白保守序列》

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《茶树CsAAPs亚家族基因的克隆与表达分析》

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利用MEGA 7软件将Cs AAPs蛋白序列与拟南芥、葡萄、可可、烟草和咖啡中的AAPs亚家族共23条蛋白序列构建亲缘关系树。由图1可见，AAPs亚家族主要被分为3组，其中组1中包括AAP3和AAP4，组2包括AAP6和AAP8，组3仅包括AAP7。不同茶树Cs AAPs与其他物种的AAPs分别聚类到同一小组中，这表明了茶树的Cs AAPs亚家族基因在进化上是相对保守的。使用MEME在线软件分析，结果如表4和图2所示，5个Cs AAPs基因包含20个保守基序，其中保守基序的motif 1—motif 14以及motif 20在Cs AAPs亚家族中广泛存在。而motif 15只存在于组3的Cs AAP7中；motif 16只存在于Cs AAP6中；motif 17存在于组1的Cs AAP3和Cs AAP4中；motif 19只存在于Cs AAP8中。采用NCBI的CDD(Conserved domain database）在线数据库对氨基酸序列进行保守结构域分析，结果显示，5个基因均包含Aa＿trans(Transmembrane amino acid transporter protein，登录号：pfam01490）结构域，归属SLC5-6-like＿sbd亚家族，该亚家族具有转运氨基酸的功能，可将Na+与糖、氨基酸等共同转运。DNAMAN序列比对结果如图3所示，Cs AAPs亚家族蛋白的同源性较高，为70.27%。其中Cs AAP3和Cs AAP4的序列相似度达77.62%，而与其他序列的相似度不足60%。