《表5 茶树Cs AAPs亚家族蛋白理化性质分析》
如表5所示,利用Protparam对Cs AAPs的氨基酸序列进行理化性质预测,结果显示Cs AAP3、Cs AAP4、Cs AAP6、Cs AAP7和Cs AAP8分别编码483、485、483、464、480个氨基酸;相对分子量最大为53.48 k Da,最小为51.35 k Da。Cs AAP3、Cs AAP4、Cs AAP6、Cs AAP8理论等电点分别为8.94、8.86、9.14、8.78,均为碱性蛋白质;Cs AAP7的理论等电点4.93,为酸性蛋白质。Cs AAPs基因编码蛋白的稳定指数均在30以上,说明该亚家族转运蛋白为稳定蛋白。5个Cs AAP蛋白的平均疏水性值大于0.300,说明Cs AAPs亚家族转运蛋白为疏水蛋白,与Protscale的预测结果一致。利用Signal P 4.1进行信号肽预测,结果显示没有明显的信号肽序列,说明该亚家族蛋白为非分泌型蛋白。通过Softberry网站在线预测蛋白的亚细胞定位,显示Cs AAPs蛋白定位在质膜上,为膜蛋白。同时,利用TMHMM对Cs AAPs亚家族蛋白序列进行跨膜区的预测,结果显示Cs AAP4和Cs AAP6有9个跨膜区,Cs AAP3、Cs AAP7和Cs AAP8有10个跨膜区。
图表编号 | XD00145379300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.15 |
作者 | 郭玲玲、张芬、成浩、韦康、阮丽、吴立赟、王丽鸳 |
绘制单位 | 中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心 |
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