《表3 CASP蛋白理化性质、二级结构和亚细胞定位分析》
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《文心兰类原球茎形态建成及电子传递蛋白和凯氏带蛋白基因的极性表达模式分析》
保守功能域分析结果表明CASP基因属于MAEVEL超家族,包含DUF588结构域。对14个CASP基因序列生物信息学分析发现(表3),CASP蛋白序列的长度在179~331 aa之间,预测蛋白相对分子量(Mr)在19 117.23~36 824.78之间,等电点在5.04~10.17之间。根据预测的理论等电点发现有3个CASP蛋白为碱性蛋白,其余9个均为酸性蛋白;蛋白不稳定系数7个大于40,表明有7个CASP基因属于不稳定蛋白,其余7个为稳定蛋白;平均亲水系数2个为负值,表明有2个CASP蛋白是亲水蛋白。二级结构分析发现,CASP蛋白中无规则卷曲所占的比例最大。为研究文心兰CASP在植物进化过程中的保守性,选取拟南芥、水稻、玉米、菠萝和铁皮石斛5个物种的CASP基因编码的氨基酸序列与文心兰CASP基因编码的氨基酸序列进行聚类分析,图7表明文心兰CASP基因在进化过程中与铁皮石斛和菠萝有较近的亲缘关系。
图表编号 | XD00205261700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.25 |
作者 | 王雪晶、李蓉、王姗姗、张婧、林玉玲、陈裕坤、林争春、陈青青、叶开温、赖钟雄、徐涵 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、台湾大学植物科学研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、法国图卢兹综合科学研究所(IRIT-ARI) |
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