《表2 NtARF家族蛋白理化性质、二级结构和亚细胞定位分析》

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《基于转录组的‘黄花2号’水仙ARF基因家族分析》


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对12个全长的NtARF基因序列生物信息学分析(表2)发现,NtARF蛋白序列的长度在193 aa(ARF12)-1 096 aa(ARF21)之间,预测蛋白相对分子量(Mr)在20.46-122.20之间,等电点在5.19-7.97之间.根据预测的理论等电点发现有3个ARF蛋白为碱性蛋白,其余9个均为酸性蛋白;蛋白不稳定系数均大于40,表明12个全长的ARF基因均为不稳定蛋白;平均亲水系数均为负值,表明12个ARF蛋白都是亲水蛋白.二级结构分析发现,NtARF家族蛋白中无规卷曲所占的比例最大,除ARF21占比都超过了50%.亚细胞定位预测均位于细胞核中.