《表3 AmSPL家族蛋白二级结构和亚细胞定位分析》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《苋菜AmSPL基因家族转录组鉴定及表达分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

基于苋菜转录组数据库，通过关键词对4个蛋白数据库的注释进行搜索，初步获得52个SPL家族的相关基因，进一步通过SMART分析，最终得到17个SPL家族基因，为使后续分析更加方便，根据转录组编号的顺序命名为AmSPL1（CL10801.Contig1＿All）～AmSPL17(Unigene9395＿All）。由表2和表3可知，AmSPLs蛋白长度在186～777个氨基酸，蛋白相对分子量在20.53～88.27ku，其中有6个AmSPL蛋白属于酸性蛋白，其余11个为碱性蛋白；除了AmSPL16其余蛋白不稳定系数均>40，表明除AmSPL16，其余均为不稳定蛋白；平均亲水系数均为负值，表明17个AmSPL蛋白都是亲水蛋白。二级结构分析发现，无规则卷曲占据的比例最大，均>50%，亚细胞定位预测结果均定位在细胞核，并且推测AmSPL4，AmSPL11和AmSPL12同时定位在细胞质中。