《表1‘三月李’及其红肉突变体ARF家族基因及其编码蛋白质的理化性质和亚细胞定位》

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《基于转录组的‘三月李’及其红肉突变体ARF基因家族鉴定及分析》


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为了解‘三月李’及其红肉突变体ARF家族蛋白质与桃、拟南芥和番茄的进化关系,采用MEGAX软件构建了‘三月李’及其红肉突变体ARF家族蛋白质与桃、拟南芥和番茄ARF家族蛋白质的系统进化树.如图1所示,桃、拟南芥、番茄和李ARF家族蛋白质可分为5组,17个李PsARF家族蛋白质和17个桃PpARF家族蛋白质分别属于Class 1、2、3和4,且每个PsARF蛋白质都有与其配对的桃PpARF同源序列.Class3的PsARF家族蛋白质数量最多,共有6个,分别为PsARF12、PsARF13、PsARF14、PsARF15、PsARF16和PsARF17.其次为Class 1,共含有5个PsARF家族蛋白质,分别为PsARF3、PsARF4、PsARF5、PsARF7和PsARF11;Class 4含有4个PsARF家族蛋白质,分别为PsARF1、PsARF2、PsARF6和PsARF8;PsARF9和PsARF10与来自拟南芥和番茄ARF3和ARF4属于Class 2.值得注意的是,与Class 1、2、3和4不同,Class 5仅含有拟南芥和番茄ARF蛋白质,不含PsARF蛋白质.