《表2 PsARF家族蛋白质保守结构域位置》

《表2 PsARF家族蛋白质保守结构域位置》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于转录组的‘三月李’及其红肉突变体ARF基因家族鉴定及分析》


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对Ps AR F蛋白质的保守结构域进行分析,发现17个PsARF蛋白质均含有B3结构域和Auxin-resp结构域,其中12个PsARF含有B3结构域、Auxin-resp结构域和AUX-IAA结构域(图2).PsARF1、PsARF2、PsARF6、PsARF8和PsARF9仅含有B3结构域和Auxin-resp结构域,不含AUX-IAA结构域(图2和表2).为了进一步了解PsARF家族蛋白质的保守结构域,利用在线软件对李PsARF家族蛋白质进行分析,结果表明,李PsARF家族蛋白质共含有15个保守基序,不同PsARF蛋白质含有的基序数量和类型存在一定的差异(图3).其中,基序1、2和10属于B3结构域.Auxin_resp结构域包含5个基序,分别为基序6、7、8、11和12.17个PsARF蛋白质均含有基序6、7和8,但PsARF1不含基序11和12,PsARF2、PsARF6和PsARF8不含有基序11.基序5、9和13属于AUX-IAA结构域.共有12个PsARF蛋白质含有基序5、9和13,PsARF2和PsARF6仅含有基序5和9,PsARF8仅含有基序9,而PsARF1和PsARF9不含基序5、9和13.基序14和15为未知基序(图3).其中,基序14仅在PsARF15出现,基序15仅在PsARF12、PsARF13和PsARF14出现(图3).