《表2 原始小球藻AP2蛋白保守结构域数量和位置》

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《原始小球藻AP2转录因子的生物信息学分析》


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蛋白成员中,不同基因蛋白成员的AP2保守结构域的数量和位置各不相同,其中XP_011396127.1(K38-L96,R118-Y178,F200-E260)和XP_011401790.1(S67-D104,W188-A233,S264-E322)两个成员各含3个保守结构域;XP_011398158.1(Y50-E111)和XP_011400550.1(Y29-E96)两个成员中各自都只含有1个氨基酸保守结构域;余下的XP_011395646.1(Y59-T111,F151-A207)、XP_011396011.1(Q169-A233,S264-G322)、XP_011400319.1(K174-E235,Y265-E326)和XP_011401904.1(Q258-E333,F363-E426)4个成员,均包含2个保守结构域。保守结构域跨度最大成员是XP_011401904.1(Q258-E333),其氨基酸数量达75个,蛋白成员XP_011401790.1(S67-D104)中保守结构域跨度最小,其氨基酸数量为37个(表2,图2)。各个蛋白成员的位置和跨度都各不相同,但却有相似,如XP_011395646.1、XP_011400319.1和XP_011401904.1这3个成员就含有相似之处(图2)。信号肽分析表明原始小球藻AP2蛋白均不存在信号肽,属于非分泌型蛋白。TMHMM跨膜域结构分析表明原始小球藻所有蛋白成员均不含跨膜结构域,推断该蛋白为非跨膜蛋白。