《表1 原始小球藻AP2蛋白的理化特性》

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《原始小球藻AP2转录因子的生物信息学分析》


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注:(Asp+Glu)为带负电荷的残基总数;(Arg+Lys)为带正电荷的残基总数。

由表1可知,原始小球藻AP2转录因子蛋白家族含有8个成员,该蛋白家族氨基酸数目范围为247~715;等电点范围为5.81(XP_011398158.1)~9.39 (XP_011396011.1),其中,XP_011395646.1、XP_011396011.1、XP_011400319.1和XP_011401904.1,理论等电位点>7,为碱性氨基酸,XP_011396127.1、XP_011401790.1、XP_011400550.1和XP_011398158.1,理论等电位点<7,为酸性氨基酸;该家族成员带负电氨基酸残基数目范围为26 (XP_011395646.1)~85(XP_011401790.1);该家族成员带正点氨基酸残基数目范围为26 (XP_011398158.1)~81(XP_011401790.1);不稳定指数均大于40 (不稳定系数<40时稳定)(夏巧玉,2007),推断为不稳定蛋白;脂肪指数范围为58.87(XP_011401790.1)~74.26(XP_011400550.1);原始小球藻AP2蛋白成员进行的亚细胞定位分析中显示该家族全部成员的亚细胞都可定位于细胞质(Cytoplasm),其中4个蛋白成员:XP_011396011.1、XP_011400319.1、XP_011401790.1和XP_011398158.1的亚细胞只定位于细胞质(表1)。通过氨基酸组成分析可知,在所有蛋白成员中,除了XP_011396011.1(氨基酸的最大含量为甘氨酸15.80%)和XP_011398158.1(氨基酸的最大含量为亮氨酸11.10%)两个蛋白家族成员外,其余六个蛋白家族成员含量最高的氨基酸均为丙氨酸,丙氨酸含量最高的成员为XP_011400550.1 (19.70%),含有丙氨酸数为60,丙氨酸含量最低的成员为XP_011400319.1(11.2%),含有丙氨酸数为38(图1)。