《表1 毛竹GMD基因及其蛋白理化特性》

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《毛竹GMD基因家族全基因组鉴定与表达分析》

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通过植物GMD同一PFAM （PF16363.2）号搜索出其家族成员，通过E-value≤1E-20筛选初步得到44个成员，进一步经过保守结构域、motif特征分析，去除相同转录本重复，最终筛选得到39个GMD家族成员。将获得39个GMD家族成员，按照其在染色体的分布顺序分别命名为Pe GMD1～Pe GMD39 （表1）。进一步对Pe GMD进行蛋白特性分析，39个GMD蛋白中长度最短的为115 aa （Pe GMD7），最长的为675 aa（Pe GMD19），平均长度365 aa；各GMD蛋白质等电点最小为5.63 （Pe GMD29），最大的为11.19 （Pe G-MD39），平均等电点为8.23；GMD蛋白质的分子量最小的为12.79 k D （Pe GMD7），最大的为76.07 k D （PeGMD34），平均分子量为40.49 k D。从内含子的数量上来看，Ⅰ组明显高于Ⅱ、Ⅲ两组。