《表2 基本理化性质:橄榄CaERF109和CaABR1基因的克隆及其表达特性分析》
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《橄榄CaERF109和CaABR1基因的克隆及其表达特性分析》
橄榄CaERF109和CaABR1的组成和基本理化性质如表2所示。二者均属于不稳定疏水性蛋白,均为碱性氨基酸,等电点差异较小,但在分子量、原子数和氨基酸种类上存在明显差异,CaERF109中含量最高的氨基酸为苏氨酸(11.2%),而CaABR1含量最高的为丝氨酸(13.5%)。在结构上,CaERF109和CaABR1分别由28.47%和23.27%的α-螺旋(α-helix),15.59%和12.65%的β-折叠(β-extended strand),4.41%和8.98%的β-转角(β-turn),51.53%和55.10%的随机卷曲(random coil)组成,均不含有信号肽和卷曲螺旋结构,但CaABR1包含2个由内到外和3个由外到内的跨膜螺旋结构,此外二者分别含有46(S∶T∶Y=20∶24∶2)和51(S∶T∶Y=44∶22∶5)个磷酸化位点。亚细胞定位预测表明,CaERF109可能定位于线粒体基质,其次是过氧化物酶体;而CaABR1可能定位于过氧化物酶体,其次是细胞核。保守结构域预测发现,橄榄CaERF109和CaABR1均含有单个AP2保守结合域,分别介于127~188和267~318氨基酸位点之间,均具有AP2/ERF家族转录因子中ERF亚族的典型特征(图2;3)。三维结构预测发现,CaERF109和CaABR1与ERF096(PDB:5wx9.1.A)相似度最高,分别达到63.24%和64.62%。
图表编号 | XD0038777900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.25 |
作者 | 赖瑞联、陈瑾、冯新、王仲、陈义挺、吴如健 |
绘制单位 | 福建省农业科学院果树研究所、福建省农业科学院果树研究所、福建省农业科学院果树研究所、贺州学院食品与生物工程学院、福建省农业科学院果树研究所、福建省农业科学院果树研究所 |
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