《表1 烟草bZIP蛋白的基本理化特性》

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《烟草bZIP基因家族的生物信息学分析》


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利用pfam和hmmer工具分析烟草b ZIP基因蛋白的结构域,共筛选得到20条烟草b ZIP目标序列,将这20条序列按照其基因名称排序为NT1-NT20。通过对烟草b ZIP基因编码蛋白的理化性质进行分析,发现b ZIP蛋白在氨基酸数量、分子量、等电点等方面存在着差异。理化性质分析结果显示(表1),烟草b ZIP基因家族的氨基酸数目在135-8111aa之间,NT20的氨基酸数目较其他序列差异最大,其氨基酸数目最多;bZIP基因家族的分子量从15579.76KD(NT17)到87218.23KD(NT20);b ZIP蛋白的等电点在4.84-9.76之间,其中NT4、NT7、NT8、NT12、NT17、NT19等电点大于7,是碱性蛋白质,其余的都是酸性蛋白质。利用在线工具进行亚细胞定位,发现NT6、NT20存在于细胞质中,其余皆存在于细胞核中。推测b ZIP蛋白主要在细胞核内发挥重要功能。