《表1 烟草bZIP基因家族保守序列位置和蛋白理化性质》

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《烟草bZIP基因家族的鉴定及其A亚族在ABA处理下的表达分析》


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以bZIP结构域相关的HMM文件为检索条件,利用Hmmer3.0软件在下载得到的‘K326’全基因蛋白质数据库中共检索得到141个序列,经过NCBI网站的CDD(Conserved domains database)软件去除不完整序列和错报序列后,最终得到105个烟草bZIP基因家族的序列。其保守结构域的长度在35~59,理化性质和亚细胞定位结果显示(表1):105个蛋白序列分子量分布为12 913.63~104 640.38 Da,蛋白间分子量差异较大;等电点分布为4.91~9.79;均属于亲水蛋白;大部分蛋白序列为非稳定蛋白(仅3条为稳定蛋白);该基因家族中71个蛋白位于细胞核,34个蛋白位于细胞间隙。