《表1 绿豆AP2/ERF转录因子成员鉴定及蛋白质理化分析》

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《绿豆AP2/ERF转录因子家族的生物信息学鉴定与特征分析》


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不同AP2/ERF转录因子蛋白序列的氨基酸组分及理化性质不同,组成蛋白的氨基酸残基数也因类别不同差异较大。绿豆AP2/ERF转录因子家族成员间,AP2亚家族成员的平均氨基酸残基数最多达到了500个氨基酸,而平均氨基酸残基数最少的是RAV亚家族,平均为217个。总体上看,各转录因子蛋白的理论等电点在4.87 (Mu ERF7)到9.72 (Mu ERF12)之间,65个转录因子蛋白的理论等电点在酸性范围内,1个AP2亚族转录因子(Mu ERF75)为中性,21个转录因子蛋白的理论等电点在碱性范围内。分子量最小的转录因子是Mu ERF23,大小为13.99 k D,分子量最大的为Mu ERF84,大小为75.40 k D。脂肪系数指的是脂肪族氨基酸指数,可作为蛋白热稳定性的判定指标,绿豆AP2/ERF转录因子蛋白的热稳定性较高,ERF-B5亚组的平均热稳定性最高,REB-A3亚组的平均热稳定性最低(表1)。