《表3 马铃薯PPO蛋白序列保守结构域位置与序列长度》

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《马铃薯多酚氧化酶基因家族生物信息学及表达分析》

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在12个马铃薯PPO蛋白序列中，有8个蛋白序列具有3个典型结构域（Tyrosinase、PPO1＿DWL、PPO1＿KFDV），Stu PPO5、Stu PPO12分别具有1个和2个典型结构域，Stu PPO10和Stu PPO11不具有典型结构域（表3），推测这些基因在复制过程中可能发生片段丢失，预示着其功能可能丧失。马铃薯PPO蛋白的Tyrosinase结构域长度为95～215个氨基酸。蛋白序列比对显示Stu PPO5在Cu B活性中心处缺失，Stu PPO7、Stu PPO12在Cu A活性中心处缺失（图2）。活性中心的缺失暗示着其功能可能丧失。PPO1＿DWL结构域长度51～52个氨基酸；PPO1＿KFDV结构域长度为131～136个氨基酸（表3）。此外，PPO基因N端一般具有1个类囊体转移结构域（thylakoid transfer domain），负责将成熟的PPO转移到叶绿体类囊体膜[6]。在马铃薯PPO蛋白序列中，除StuPPO12外，其余蛋白均具有1个保守的类囊体转移结构域。Stu PPO9的N端还包含1个跨膜结构域（transmembrane domain）。