《表2 水貂Agouti基因序列中保守域预测》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《601 bp SINE插入突变导致水貂Agouti基因沉默》
分析水貂Agouti基因序列获得4个保守域(表2),其中2个为Agouti基因的保守域:长171 bp的g.23802~23972区域为Agouti基因第4外显子保守域,与雪貂、狗、狐狸、熊猫、山羊(Capra hircus)、绵羊和牛的Agouti mRNA序列相似度在85%以上;长147 bp的g.18267~18413区域为Agouti第2外显子保守域,与雪貂、狗、熊猫、鼬鼠(Mustela kathiah)、太平洋海象(Odobenus rosmarus)、威德尔海豹(Leptonychotes weddellii)、狐狸和猫等的Agouti m RNA序列相似度在85%以上。另1个保守域为位于Agouti基因内含子1的转座酶22家族;还有1个保守域是RT_nLTR_like,位于Agouti基因内含子1 g.9474~10262区域,与水貂长4 147 bp的长散在重复序列元件(long interspersed nuclear element,LINE)(GenBank No.JF288184) 的相似度为98%。比对分析发现,Agouti基因的g.8902~11969区域与该LINE的g.1086~4147区域相似度为91%,推测Agouti基因g.8902上游的g.6936~8901未知区域包含LINE的g.1~1805序列,水貂Agouti基因内含子1的g.6936~11969区域间包含长4 147 bp的完整LINE序列。
图表编号 | XD0038776200 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.02.25 |
作者 | 李兰会、杜小龙、王麒、张乐超、葛琳涵、周荣艳、李雪梅、李祥龙 |
绘制单位 | 河北农业大学动物科技学院、河北省牛羊胚胎工程技术研究中心、河北农业大学动物科技学院、河北农业大学动物科技学院、河北农业大学动物科技学院、河北农业大学动物科技学院、河北农业大学动物科技学院、河北农业大学动物科技学院、河北科技师范学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |