《表4 候选基因的保守结构域分析》

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《番茄抗叶霉病基因Cf-12定位及候选基因分析》

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通过SMART（http://smart.embl.de/）等生物信息学平台对候选基因保守结构域作相关功能和结构分析（图7；表4）。Cf＿candidate gene 1所编码的蛋白拥有抗病基因典型LRR重复序列结构域特征，并且存在信号肽结构域，一个TM区和短胞内区，在P1、P2两亲本间，该段基因核苷酸序列上有52个SNP位点，该基因在NCBI上没有被注释；Cf＿candidategene2基因在P1、P2核苷酸序列上有45个SNP位点，Ccg2基因在P1上存在一个明显长度为72 bp InDel插入序列，并且可以证明该序列中具有一个SNP位点，这一位点其实被证明是同义突变，编码天门冬酰胺（Asn，N），Cf＿candidate gene 2含碱基数为2 553，这些共可以编码氨基酸850个；Cf＿candidate gene 3基因在P1、P2核苷酸序列上存在47个SNP位点，在Ccg3基因第一个exon区，存在1个InDel插入，为GAA，在Ccg3基因Intron 3-4区存在一个由TA到TAA的单碱基插入，在Cf＿candidate gene 3的3'UTR区发现具有InDel位点缺失，分别为2个CA到C的单碱基A的缺失，另外一个为AAC到A的AC两个碱基的缺失，Cf＿candidate gene 3含碱基数共2 736个，共可以编码911个氨基酸。