《表3 芍药MADS-box蛋白的保守结构域》

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《芍药MADS-box基因家族的鉴定及适应性进化分析》

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为了进一步明确芍药MADS-box基因家族编码蛋白的保守性，将23个MADS-box基因家族成员分为7个亚族，分别是AP1、PI、AP3、AG、AGL、SEP1和SEP3亚族，并利用MEME鉴定其保守基序，预测到的5个保守基序，分别命名为motif 1～motif 5（表3）。AP1亚族和AP3亚族均由motif 1、motif 2、motif 3和motif 5等保守基序组成；PI亚族由motif 1、motif 2、motif 3和motif 4等保守基序组成；而AG亚族，AGL亚族，SEP1亚族和SEP3亚族则均由motif 1、motif 2和motif 5等保守基序组成（图2）。将预测到的motif 1～motif 5提交至SMART在线软件进行注释，发现motif 1是MADS结构域，motif 2是K-box结构域，而motif 3、motif 4和motif 5这三个motif的具体功能未知。由此可知，本研究所收集的芍药MADS-box基因家族编码的蛋白都包含有MADS结构域和K-box结构域，芍药MADS-box基因家族具有高度的保守性，并且同一亚族类型成员间所含的motif种类和数量相一致。