《表2 番茄typeⅡ型MADS-box蛋白的二级结构及信号肽分析》

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《番茄type Ⅱ型MADS-box基因家族生物信息学分析》

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为深入了解番茄typeⅡ型MADS-box蛋白的结构和功能特征，借助在线软件SOPMA，分析其二级结构。家族成员的结构比例由高到低依次是α-螺旋、无规则卷曲、延伸链、β-转角。α-螺旋比例介于36.83%～67.26%之间，β-转角比例介于2.18%～8.88%之间，无规则卷曲程度在15.25%～44.31%之间，预测α-螺旋、无规则卷曲可能在MADS-box蛋白二级结构中可能起主要作用。信号肽分析结果表明：SEP亚家族、AP1-FUL亚家族、SOC1亚家族、AGL17亚家族和SVP亚家族等含有信号肽属于分泌型蛋白，其他亚家族中的基因均为非分泌性蛋白（表2）。