《表2 Cs UBC24蛋白二级结构和信号肽预测》

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《黄瓜CsamiR399b及其靶基因CsUBC24的生物信息学分析》

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通过NPS@:SOPMA分析了黄瓜CsUBC24蛋白序列，预测其二级结构，发现黄瓜CsUBC24蛋白主要由4种构象组成（表2），其中无规则卷曲（Cc）含有424个氨基酸，占整体的46.59%，比例最高；其次为α-螺旋（Hh）和延伸链（Ee），分别由246，176个氨基酸构成，占整体的27.03%和19.34%；β-转角（Tt）比例较少，有64个氨基酸，占整体的7.03%。蛋白质的N端是否带有信号肽可判别该蛋白质是否为分泌蛋白，一个标准的信号肽，其C值和Y值应约等于+1，在剪切位点前后S值应该呈先上升后下降趋势。使用SignalP 5.0对黄瓜CsUBC24蛋白进行信号肽分析，得到C、Y、S值分别为0.111，0.105，0.121（表2）。可以判断，CsUBC24蛋白没有信号肽，不是分泌蛋白。