《表3 Cs UBC24蛋白的亚细胞定位预测》

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《黄瓜CsamiR399b及其靶基因CsUBC24的生物信息学分析》

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分析跨膜蛋白不仅可以了解特定生物膜的功能，而且有助于进一步确定蛋白质的定位与功能。经蛋白质跨膜性预测分析，CsUBC24蛋白没有跨膜结构，全部在膜外（图3）。细胞中蛋白质的位置决定了该蛋白质的功能。通过在线软件TargetP 1.1Server预测黄瓜CsUBC24蛋白的亚细胞定位，发现CsUBC24蛋白位于叶绿体、线粒体或分泌通路的可能性较小（表3）。利用WoLF PSORT Prediction预测黄瓜CsUBC24蛋白的分布位置可知，该蛋白质位于细胞核。通过在线软件Plant-mPLoc再次验证，确定CsUBC24蛋白定位于细胞核上。CsUBC24蛋白的亲水氨基酸所占比例高达62.75%，而疏水性氨基酸为36.37%（图4）。由于亲水性区域所占比例远大于疏水性区域，因此，可以确定CsUBC24蛋白为可溶性蛋白。其中，亲水性最强的是第836位的丙氨酸，其值为-2.856。